Gelecekte mevcut dünya insanlara yetmediği için yaşanılacak yeni bir gezegen arayışına girişilir. Arayışlar başarıyla sonuçlanır. Onlarca gezegeni bünyesinde bulunduran yeni bir güneş sistemine geçiş yapılır.
Gezegenler yıllarca süren uğraşlar sonucu yeniden yapılandırılır. Birbirinden ayrılan gezegenler, ortak bir amaç, barış ve yönetim biçmi oluşturmak için ittifak ederler. İttifakın dışında kalanlar ise düşmanlar, yani yağmacılardır..
İttifakı yöneten parlemento, vahşi yağmacılarla karşı halkı korumak amacıyla bir savunma sistemi oluşturmak için çok gizli deneyler yapmaya başlarlar. Savunma sisteminin omurgası insandır ve deneyler, insanlar üzerinde yapılmaktadır..
Denekler arasında parlementoyu ve bilim adamlarını en çok heyecanlandıran River isimli bir genç kızdır. River hem bir medyumdur hemde zihni doğru şekilde tetiklendiğinde narin görünüşünün aksine tam bir ölüm makinasına dönüşenmektedir. Ancak çalışmalar tam anlamıyla başarıyla sonuçlanmamıştır. River ın tetik mekanizması oldukça dengesiz bir şekilde çalışmakta ve bu haliyle güvenden çok tehtit oluşturmaktadır..
Simon, kardeşinin bir hamster gibi kullanılmasına razı olmayarak araştırma merkezinden River ı gizlice çıkartır. Kaçmak için de eski bir ordu mensubu olan, şimdilerde ise gemisi ve ekibiyle taşımacılık yapan kaptan Malcolm Reynolds ın Serenity adlı gemisine binerler.. Parlemento en başarılı denekini geri almak için River ın, dolayısıyla Serenity nin peşine düşer. Kaptan Malcolm ve ekibinin ise genç kızı vermeye hiç niyeti yoktur...